Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M4

Rps6kb2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb2Q9Z1M4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6kb2Q9Z1M4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6kb2Q9Z1M4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms