Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngr4Q9Z1L2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syngr4Q9Z1L2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms