Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NgfrQ9Z0W1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NgfrQ9Z0W1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms