Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn15Q9Z0S5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn15Q9Z0S5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms