Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lemd3Q9WU40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lemd3Q9WU40 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms