Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn4Q9WU22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms