Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTZ1

Rnf7, RING-box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf7Q9WTZ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf7Q9WTZ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf7Q9WTZ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms