Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam50bQ9WTJ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam50bQ9WTJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam50bQ9WTJ8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms