Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc2Q9R244 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc2Q9R244 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trpc2Q9R244 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc2Q9R244 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc2Q9R244 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trpc2Q9R244 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trpc2Q9R244 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trpc2Q9R244 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms