Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma1Q9R1P4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma1Q9R1P4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms