Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb3Q9R1P1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb3Q9R1P1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms