Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma4Q9R1P0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma4Q9R1P0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms