Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntn3Q9R1A3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntn3Q9R1A3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntn3Q9R1A3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntn3Q9R1A3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntn3Q9R1A3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms