Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc26a4Q9R155 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc26a4Q9R155 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms