Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg1Q9R0Y8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg1Q9R0Y8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms