Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Plod1Q9R0E2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms