Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr54Q9R0D8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms