Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Nek3Q9R0A5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Nek3Q9R0A5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Nek3Q9R0A5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek3Q9R0A5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms