Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh2d3cQ9QZS8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms