Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Usp21Q9QZL6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Usp21Q9QZL6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Usp21Q9QZL6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Usp21Q9QZL6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms