Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn8Q9QZ49 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ubxn8Q9QZ49 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms