Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnnt3Q9QZ47 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt3Q9QZ47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt3Q9QZ47 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms