Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phtf1Q9QZ09 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms