Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd1Q9QY80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd1Q9QY80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms