Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pcsk1nQ9QXV0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms