Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg2Q9QXK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg2Q9QXK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms