Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hacl1Q9QXE0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hacl1Q9QXE0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms