Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Homer2Q9QWW1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Homer2Q9QWW1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms