Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chaf1aQ9QWF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Chaf1aQ9QWF0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms