Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rai2Q9QVY8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rai2Q9QVY8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms