Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma6Q9QUM9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma6Q9QUM9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms