Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vstm2bQ9JME9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms