Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cul3Q9JLV5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul3Q9JLV5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms