Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmod4Q9JLH8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Tmod4Q9JLH8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmod4Q9JLH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Tmod4Q9JLH8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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