Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot9Q9JKY0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnot9Q9JKY0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms