Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms