Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx5Q9JKQ4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms