Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx6Q9JKK1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx6Q9JKK1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms