Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rcan3Q9JKK0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcan3Q9JKK0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms