Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nectin1Q9JKF6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nectin1Q9JKF6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms