Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp5Q9JKD3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp5Q9JKD3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms