Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pard6bQ9JK83 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms