Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnga3Q9JJZ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms