Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl3Q9JJR7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ascl3Q9JJR7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms