Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ctnnbip1Q9JJN6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms