Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc22Q9JIG7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc22Q9JIG7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms