Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copb1Q9JIF7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms