Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MkksQ9JI70 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MkksQ9JI70 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms