Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI08

Bin3, Bridging integrator 3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bin3Q9JI08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bin3Q9JI08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bin3Q9JI08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bin3Q9JI08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bin3Q9JI08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bin3Q9JI08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms