Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtaQ9JHK4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtaQ9JHK4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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